《分子系統發育與進化》(Molecular Phylogenetics And Evolution)是一本以生物-進化生物學綜合研究為特色的國際期刊。該刊由Academic Press Inc.出版商創刊于1992年，刊期Monthly。該刊已被國際重要權威數據庫SCIE收錄。期刊聚焦生物-進化生物學領域的重點研究和前沿進展，及時刊載和報道該領域的研究成果，致力于成為該領域同行進行快速學術交流的信息窗口與平臺。該刊2023年影響因子為3.6。CiteScore指數值為7.5。
Molecular Phylogenetics and Evolution is dedicated to bringing Darwin's dream within grasp - to "have fairly true genealogical trees of each great kingdom of Nature." The journal provides a forum for molecular studies that advance our understanding of phylogeny and evolution, further the development of phylogenetically more accurate taxonomic classifications, and ultimately bring a unified classification for all the ramifying lines of life. Phylogeographic studies will be considered for publication if they offer EXCEPTIONAL theoretical or empirical advances.
《分子系統發生學和進化》致力于實現達爾文的夢想——“擁有自然界每個偉大王國的相當真實的家譜樹”。該期刊為分子研究提供了一個論壇，這些研究促進了我們對系統發生和進化的理解，進一步發展了系統發生學上更準確的分類學，并最終為所有分支生命線帶來了統一的分類。如果系統地理學研究提供了卓越的理論或經驗進展，我們將考慮發表。
《Molecular Phylogenetics And Evolution》(分子系統發育與進化)編輯部通訊方式為ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE, 525 B ST, STE 1900, SAN DIEGO, USA, CA, 92101-4495。如果您需要協助投稿或潤稿服務，您可以咨詢我們的客服老師。我們專注于期刊咨詢服務十年，熟悉發表政策，可為您提供一對一投稿指導，避免您在投稿時頻繁碰壁，節省您的寶貴時間，有效提升發表機率，確保SCI檢索（檢索不了全額退款）。我們視信譽為生命，多方面確保文章安全保密，在任何情況下都不會泄露您的個人信息或稿件內容。
2023年12月升級版
| 大類學科 | 分區 | 小類學科 | 分區 | Top期刊 | 綜述期刊 |
| 生物學 | 1區 | BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 生化與分子生物學 GENETICS & HEREDITY 遺傳學 EVOLUTIONARY BIOLOGY 進化生物學 | 1區 1區 2區 | 是 | 否 |
2022年12月升級版
| 大類學科 | 分區 | 小類學科 | 分區 | Top期刊 | 綜述期刊 |
| 生物學 | 1區 | BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 生化與分子生物學 EVOLUTIONARY BIOLOGY 進化生物學 GENETICS & HEREDITY 遺傳學 | 1區 1區 1區 | 是 | 否 |
2021年12月舊的升級版
| 大類學科 | 分區 | 小類學科 | 分區 | Top期刊 | 綜述期刊 |
| 生物學 | 1區 | BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 生化與分子生物學 GENETICS & HEREDITY 遺傳學 EVOLUTIONARY BIOLOGY 進化生物學 | 1區 1區 2區 | 是 | 否 |
2021年12月基礎版
| 大類學科 | 分區 | 小類學科 | 分區 | Top期刊 | 綜述期刊 |
| 生物 | 2區 | BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 生化與分子生物學 EVOLUTIONARY BIOLOGY 進化生物學 GENETICS & HEREDITY 遺傳學 | 3區 2區 3區 | 否 | 否 |
2021年12月升級版
| 大類學科 | 分區 | 小類學科 | 分區 | Top期刊 | 綜述期刊 |
| 生物學 | 1區 | BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 生化與分子生物學 GENETICS & HEREDITY 遺傳學 EVOLUTIONARY BIOLOGY 進化生物學 | 1區 1區 2區 | 是 | 否 |
2020年12月舊的升級版
| 大類學科 | 分區 | 小類學科 | 分區 | Top期刊 | 綜述期刊 |
| 生物學 | 1區 | BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY 生化與分子生物學 EVOLUTIONARY BIOLOGY 進化生物學 GENETICS & HEREDITY 遺傳學 | 2區 2區 2區 | 是 | 否 |
基礎版：即2019年12月17日，正式發布的《2019年中國科學院文獻情報中心期刊分區表》；將JCR中所有期刊分為13個大類,期刊范圍只有SCI期刊。
升級版：即2020年1月13日，正式發布的《2019年中國科學院文獻情報中心期刊分區表升級版（試行）》,升級版采用了改進后的指標方法體系對基礎版的延續和改進，影響因子不再是分區的唯一或者決定性因素，也沒有了分區的IF閾值期刊由基礎版的13個學科擴展至18個，科研評價將更加明確。期刊范圍有SCI期刊、SSCI期刊。從2022年開始，分區表將只發布升級版結果，不再有基礎版和升級版之分,基礎版和升級版（試行）將過渡共存三年時間。
JCR分區等級：Q1
| 按JIF指標學科分區 | 收錄子集 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 學科：BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY | SCIE | Q2 | 126 / 313 |
59.9% |
| 學科：EVOLUTIONARY BIOLOGY | SCIE | Q1 | 12 / 54 |
78.7% |
| 學科：GENETICS & HEREDITY | SCIE | Q2 | 57 / 191 |
70.4% |
| 按JCI指標學科分區 | 收錄子集 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 學科：BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY | SCIE | Q1 | 71 / 313 |
77.48% |
| 學科：EVOLUTIONARY BIOLOGY | SCIE | Q2 | 15 / 54 |
73.15% |
| 學科：GENETICS & HEREDITY | SCIE | Q1 | 41 / 191 |
78.8% |
| Gold OA文章占比 | 研究類文章占比 | 文章自引率 |
| 31.95% | 99.52% | 0.07... |
| 開源占比 | 出版國人文章占比 | OA被引用占比 |
| 0.14... | 0.1 | 0.04... |
名詞解釋：JCR分區在學術期刊評價、科研成果展示、科研方向引導以及學術交流與合作等方面都具有重要的價值。通過對期刊影響因子的精確計算和細致劃分，JCR分區能夠清晰地反映出不同期刊在同一學科領域內的相對位置，從而幫助科研人員準確識別出高質量的學術期刊。
| CiteScore | SJR | SNIP | CiteScore 指數 | ||||||||||||||||
| 7.5 | 1.206 | 1.516 |
|
名詞解釋：CiteScore是基于Scopus數據庫的全新期刊評價體系。CiteScore 2021 的計算方式是期刊最近4年（含計算年度）的被引次數除以該期刊近四年發表的文獻數。CiteScore基于全球最廣泛的摘要和引文數據庫Scopus，適用于所有連續出版物，而不僅僅是期刊。目前CiteScore 收錄了超過 26000 種期刊，比獲得影響因子的期刊多13000種。被各界人士認為是影響因子最有力的競爭對手。
歷年中科院分區趨勢圖
歷年IF值(影響因子)
歷年引文指標和發文量
歷年自引數據
2019-2021年國家/地區發文量統計
| 國家/地區 | 數量 |
| USA | 418 |
| CHINA MAINLAND | 208 |
| Brazil | 120 |
| Australia | 103 |
| GERMANY (FED REP GER) | 99 |
| England | 86 |
| Spain | 71 |
| France | 66 |
| Canada | 60 |
| Japan | 46 |
2019-2021年機構發文量統計
| 機構 | 數量 |
| CHINESE ACADEMY OF SCIENCES | 106 |
| UNIVERSITY OF CALIFORNIA SYSTEM | 62 |
| SMITHSONIAN INSTITUTION | 60 |
| CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIF... | 52 |
| CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIEN... | 45 |
| STATE UNIVERSITY SYSTEM OF FLORIDA | 41 |
| UNIVERSIDADE DE SAO PAULO | 41 |
| RUSSIAN ACADEMY OF SCIENCES | 31 |
| MUSEUM NATIONAL D'HISTOIRE NATURELLE (MN... | 30 |
| UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MEXICO | 30 |
2019-2021年文章引用數據
| 文章引用名稱 | 引用次數 |
| Large-scale phylogenetic analyses provid... | 25 |
| Phylogenetic relationships and classific... | 23 |
| Incongruence between gene trees and spec... | 22 |
| Compositional heterogeneity in true bug ... | 21 |
| Transcriptome sequence-based phylogeny o... | 20 |
| A comprehensive kelp phylogeny sheds lig... | 20 |
| Prevalence of cryptic species in morphol... | 19 |
| Combining transcriptomes and ultraconser... | 19 |
| Phylogenomic support for evolutionary re... | 18 |
| Chloroplast genomic data provide new and... | 17 |
2019-2021年文章被引用數據
| 被引用期刊名稱 | 數量 |
| MOL PHYLOGENET EVOL | 1529 |
| MITOCHONDRIAL DNA B | 602 |
| SCI REP-UK | 474 |
| PEERJ | 420 |
| PLOS ONE | 343 |
| ECOL EVOL | 316 |
| ZOOKEYS | 301 |
| BMC EVOL BIOL | 267 |
| ZOOL J LINN SOC-LOND | 249 |
| J BIOGEOGR | 245 |
2019-2021年引用數據
| 引用期刊名稱 | 數量 |
| MOL PHYLOGENET EVOL | 1529 |
| MOL BIOL EVOL | 1260 |
| SYST BIOL | 1228 |
| BIOINFORMATICS | 950 |
| MOL ECOL | 762 |
| PLOS ONE | 551 |
| P NATL ACAD SCI USA | 547 |
| EVOLUTION | 466 |
| BMC EVOL BIOL | 465 |
| J BIOGEOGR | 462 |
中科院分區：1區
影響因子：7.7
審稿周期：約Time to first decision: 9 days; Review time: 64 days; Submission to acceptance: 82 days; 約2.7個月 約7.8周
中科院分區：1區
影響因子：8.1
審稿周期：約Time to first decision: 6 days; Review time: 44 days; Submission to acceptance: 54 days; 約4.1個月 約6.8周
中科院分區：3區
影響因子：3.3
審稿周期：約17.72天 11 Weeks
中科院分區：1區
影響因子：98.4
審稿周期： 約3月
中科院分區：2區
影響因子：5.8
審稿周期： 約2.4個月 約7.6周
中科院分區：2區
影響因子：5.1
審稿周期： 約1.9個月 約2.7周
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